Hal ini berlangsung hingga 1099, ketika para penganut Kristen dari Eropa (Crusader) menaklukkan Lebanon, dan negara-negara sekitar di kawasan tersebut. Selain memperluas ajaran Kristen, mereka juga berusaha membendung proses Arabisasi dan Islamisasi yang mengalir secara damai dalam masa pemerintahan Islam.
Sehingga, para Crusader dari Eropa, tersebut berusaha sekuat mungkin menancapkan pengaruh Kristen, dengan cara menghidupkan budaya Barat di tengah-tengah kehidupan Islam.
Tetapi pada tahun 1187, Kesultanan Mamluk berhasil menggulingkan dinasti Crusader, serta menguasai Lebanon dan Suriah hingga tahun 1500.
Pada tahun 1516, Imperium Ottoman mengambil alih penguasaan Lebanon, dari Mamluk dan memerintah Lebanon melalui keluarga Maan (1516-1697) dan Shihab (1697-1842) keduanya dari golongan Druze.
Saat itu, persaingan antara kelompok Kristen Maronit dan Muslim Druze memanas. yang berakhir dengan perang saudara pada tahun 1841, 1845, dan 1860. Pada masa itu juga, masa berakhirnya pemerintahan ala dinasti para Emir (Pangeran) dan munculnya Pemerintahan Mutasyarrifiyah (Gubernur), Pemerintahan Ottoman di bawah pengawasan (mandat) lima negara.