Satu buah pepaya kecil setara 157 gram, diketahui memiliki 96 miligram vitamin C. Beberapa penelitian menunjukkan bahwa asupan vitamin C yang tinggi, dapat meningkatkan risiko batu ginjal pada pria.
Namun, belum ada penelitian yang menyatakan bahwa asupan pepaya berlebih dapat menyebabkan hal yang sama. Meskipun vitamin C adalah antioksidan kuat dan diketahui meningkatkan kekebalan, perannya dalam pembentukan batu ginjal masih belum dipahami.
Makan terlalu banyak pepaya dapat mengganggu sistem pencernaan. Hal ini selanjutnya akan menyebabkan sakit perut yang ditandai dengan iritasi lambung. Kandungan serat pepaya yang tinggi bisa menyebabkan sistem pencernaan terganggu. Getah buah juga bisa menjadi biang keladinya.
Wanita di Asia disarankan untuk memasukkan salad yang dikemas dengan pepaya hijau untuk meningkatkan aliran ASI. Namun, ada juga versi yang kontradiktif.
Di belahan dunia tertentu lainnya, wanita yang sedang menyusui disarankan untuk tidak memasukkan pepaya, matang maupun mentah, dalam makanan mereka.