Manfaat asam jawa berikutnya dapat menjaga kesehatan otak. Manfaat ini didapat karena adanya kandungan vitamin B di dalamnya. Vitamin B sangat penting untuk setiap aspek fungsi otak, termasuk sintesis dan perbaikan DNA/RNA, regulasi gen, serta sintesis berbagai molekul pensinyalan. Berdasarkan sebuah penelitian, peran aktif vitamin B dalam kesehatan otak ditunjukkan oleh kemampuannya untuk diangkut melintasi penghalang darah otak, di mana melakukan sintesis neurokimiawi.